По предварительным данным, Бабаев выехал из дома на машине и подъехал к мусорному контейнеру на ул. Сумской, 46 , чтобы выбросить мусор. В этот момент жители домов услышали несколько хлопков, которые оказались выстрелами в мэра из огнестрельного оружия.
От полученных ранений Бабаев погиб на месте.